這是個寂靜的夜晚，寂靜得讓人感到有些可怕。空氣裡仿佛流動著令人不安心的因素，每一次的呼吸都讓人的心縮緊一寸。

——這也許就是所謂“暴風雨前的寧靜”吧。

一個月前，赤井秀一終於秘密查出了組織的藏身之處——一個廢棄的化工工廠。原來赤井秀一並沒有被水無憐奈殺死，他一方麵借助工藤有希子的易容術化名“衝矢昂”一直住在工藤新一家裡，另一方麵透過水無憐奈和自己本身對於組織的了解，秘密地查找組織所在。而那個化工工廠正是他們一直以來尋找的目標。這個工廠表麵上已經廢棄了，實際上組織在它內部建造了一個地下工廠。為了不打草驚蛇，一樓隻有少數幾個小嘍羅守衛，而真正支持組織運作的則是那個地下工廠。

柯南等人在精心安排和計劃之下終於決定要在今天晚上搗毀這個組織。組織裡可能有很多易爆物品，而他們並不想將附近地區的居民牽扯進來，於是最終決定在晚上行動。參加這次行動的有柯南、赤井秀一、阿笠博士、服部平次和朱蒂。而目暮警官和其他的FBI則在較遠處等待支援，如果出了什麼事情，則由博士負責和他們聯係。為了防止小哀跟著他們而發生危險，柯南事先用麻醉針讓她昏睡了過去，對小蘭、和葉聲稱小哀病了，請她們兩個人照顧她。而自己則找借口和博士、平次溜了出來。他始終還是選擇不告訴小蘭她們真相，怕她們會跟著來。

於是，他們把一切都安排好了。可以說，他們甚至做好了回不去的打算。

月亮從雲的後麵慢慢地露了出來。月光灑落在地上，漸漸地，漸漸地，在地上留下了樹的影子。

“行動！”柯南發出命令，一乾人等都從麵包車裡衝了出來，去執行早已安排好的任務。

幾個人影在這樣寂靜的夜裡闖入了這個化工工廠。

柯南按照早已準備好的工廠地形圖順利地來到了位於地下二層的資料室。

忽然，他聽到身後的門被打開了。他急忙轉身。

“灰原？你怎麼會在這兒？你不是……”

“我不是應該在博士家裡，受你女朋友的照顧，對不對？你能不能不要自以為是，自作聰明啊！你以為同樣的手法我還會被騙第二次嗎？”哀的話中少了平時的那份冷漠，多了一份生氣。

“我們也是擔心你的安危。”柯南歎氣，他也許早就該想到灰原哀可不是這麼容易就可以應付過去的。