直到後半夜，才有巡街的人發現小巷裡的幾具屍體，嚇得連滾帶爬的，到官府報案。最先到達案發現場的是順天府的府尹和衙役們。府尹當即認了出來，這幾個死者正是奉了乾隆的旨意到順天府大牢帶人犯的官兵，而他們帶走的人犯卻不知去向。府尹心下暗暗叫苦，當時見那侍衛帶的人少，也曾經提過，由順天府增派人手，倒被那侍衛以皇上旨意的名義拒絕了，如今果然出了事情，免不得連累到自己身上。

心下一麵抱怨著，一麵又有些疑惑，這條小巷子離著順天府大牢去往刑部大牢的大路很有些遠的，這些人究竟為了什麼緣故，放著大路不走，偏走到這行人稀少的地方來？一邊想著，一邊命仵作趕緊上前驗屍。仵作在幾具屍體上檢驗一番，立時驗出六個人裡頭有五個是去了勢的。

順天府尹聽仵作如此說，心裡越發疑惑，本來按著朝廷的製度，死囚轉獄當有重兵押送，豈有用太監充作官兵之理？前思後想的，越想就越覺得詭異。但一樁殺人劫囚案既然出在自己的治下，便不可不仔細查訪。趕緊將巷口封住，不許行人通過，顧不得深夜擾民，打發府裡的衙役分頭到小巷兩邊和巷口的各家各戶詢問。於是有人說出曾見了囚車從某一方向走來，衙役們聽了，便按著指引，挨家挨戶地查訪，從案發之地，直查到順天府大牢。

這府尹忙到天大亮才回到府裡，來不及歇息片刻，趕緊叫師爺擬了一份請罪的折子；並畫了逃犯的影像，大街小巷裡張貼了，懸賞捉拿；又把勘察到的案情往刑部、都察院、大理寺三法司衙門通報了；為了確定死者的身份，少不得往內務府和侍衛處投遞了文書；又因為死者中有旗下人一名，九門提督、步軍統領衙門那裡也都發了請求協查的公文，這些都是正式的公事程序，完全按照朝廷的製度行事。隻是如此一來，這樁案子免不得鬨得沸沸揚揚。

乾隆和令妃一夜沒有等到魏滿柱與太監們回宮稟報，坐臥不寧。有心打發人出去探聽，又做賊心虛，唯恐被人注意到了，洞燭其奸。好不容易熬到宮門開啟的時辰，忙忙的從床上起來，打發了親信太監出去查訪。

令妃在後宮焦急地等待，乾隆帶著兩個黑眼圈禦門聽政去了。禦門聽政的時候，文武各官都一大早的在乾清門外小廣場上候著，故而刑部、內務府等各處長官還不曾收到順天府的公文。聽政已畢，這些大員出宮的時候，早有部下拿著順天府的公文在宮門外急得團團轉了。刑部滿漢尚書和內務府總管拿到公文，不敢怠慢，趕緊回身往養心殿去找乾隆。都察院的禦史們不但帶來了順天府的公文，還拿了一摞奏折，都是得知了魏滿柱一案之後當即寫的，滿漢左都禦史拿了這些奏折，也往養心殿去了。

乾隆見了這五人一起求見，心裡便是“咯噔”一下，忙忙地宣了五個人進殿。見過了禮，刑部滿尚書鄂彌達先說道：“稟皇上，昨天夜裡驢耳朵胡同出了一樁人命案，死了六個人。順天府的府尹已經去勘驗過了，認出來是奉旨從順天府大牢往刑部大牢轉人犯的，有侍衛一名，太監五名。押送的囚車被人打開，女犯一名下落不明。”

乾隆聽說小燕子下落不明，令妃的侄子被人殺了，又驚又怒，不待鄂彌達再說下去，立即怒氣衝衝地道：“京師重地，竟然有人敢殺欽差！著刑部、順天府十日內破案，否則提頭來見。”

刑部漢尚書秦蕙田說道：“皇上，被害人中有太監五名，臣鬥膽，請皇上下旨，查清五名太監的身份。”

乾隆聽了這話，立刻漲紅了臉，叫道：“朕要的是殺人的凶手，這幾個太監是誰不用你們費心！”

鄂彌達說道：“回皇上，奴才以為，知道被害人的身份，才好去圈定嫌犯，查清殺人的動機，便於給凶手定罪。眼下這樁案子，麵上看去，似乎殺人是為了劫囚，囚犯之親友最有嫌疑。其實也許是與某個被害人有仇怨，故作劫囚的假象，引著官府去抓拿囚犯的親友，忽略真凶，這是殺人案中常見之栽贓嫁禍。故而，死去太監的身份若是不查，便可能讓死者冤沉海底。請皇上聖裁！”

秦蕙田也說道：“鄂大人所言極是。眼下這樁案子也許是殺人劫囚，可現有四處疑點，皆與被害人有關。六名被害人押送囚犯，不走大路，偏偏繞到那僻靜無人的小路上去，這是第一可疑之處；死囚轉獄，隻有六人押送，這是第二可疑之處；六名被害人中隻有一名侍衛，另外五人俱是太監，穿了兵丁服色，冒充官兵，這是第三可疑之處；轉移人犯，乃是朝廷公務，光明正大之事，本當日間辦理，不知為何，偏要選在月黑風高的夜裡去辦，這是第四可疑之處。這四處疑點不查明，這樁案子委實難以結案。”

內務府總管傅岩道：“皇上，奴才也是為此事而來。順天府已經往內務府遞了公文，請求查明五個被害太監的身份。奴才特來請旨，清查宮中以及各王府、公主府中的太監有無走失。”

乾隆這三人執意要調查五個太監的身份，氣得火冒三丈，正要發作的時候，左都禦史劉綸說道：“皇上，臣以為，三位大人所言不妥。”

乾隆聽了，這口氣略順了些，忙問道：“劉愛卿以為有何不妥？”

劉綸道：“回皇上，鄂大人、秦大人和傅大人請旨要查被害太監的身份，乃是為了殺人劫囚的小案。眼下正有一樁大案，臣以為，比起這樁大案，殺人劫囚的小案根本不足掛齒！”